Самой престижной государственной стипендией в стране поддерживают учащихся вузов с отличной успеваемостью и успехами в информатике, вычислительной технике, информационной безопасности, программной инженерии и других приоритетных направлениях модернизации отечественной экономики.

В Университете Иннополис президентские и правительственные стипендии по приоритетным направлениям стипендии получили студенты—победители и призёры Всероссийского конкурса «Цифровой прорыв», Олимпиады НТИ, Международной студенческой олимпиады по программированию ICPC, «Кибердрома», Олимпиады по информатике для студентов и Rucode: второкурсник Ренат Хайруллин и третьекурсники Владимир Махарев и Макар Шевченко и четверокурсники Илья Коломин и Михаил Рудаков, обучающиеся по программе бакалавриата «Информатика и вычислительная техника».

Несколько правительственных стипендиатов являются авторами научных статей. Исследовательские работы студентки 3 курса Аделы Крыловой о субъективном влиянии смещения угла съемки и четверокурсника Владимира Маркова о детектировании объектов и обработке изображений опубликованы в журнале IEEE Access и сборниках научных конференций. Статья о повышении производительности алгоритмов обработки изображений вышла в сборнике международной конференции «Нелинейность, информация и робототехника» у третьекурсников Романа и Артёма Вороновых, которые также получили президентские стипендии.

Двое из награждённых стипендиями правительства Российской Федерации, аспирант профиля «Теоретические основы информатики» Симеон Неделчев и бакалавр 3 курса направления «Информатика и вычислительная техника» Владимир Калабухов, изобрели и запатентовали собственные разработки: мехатронный привод на скрученных нитях и программу распознавания текста с фотоизображений сертификатов о повышении квалификации.